Datensatz

SARS-CoV-2 Sequenzdaten aus Deutschland

Für die Planung von Maßnahmen zur Eindämmung von COVID-19 kommt der genauen Kenntnis der Eigenschaften von SARS-CoV-2 eine zentrale Bedeutung zu. Eine besondere Rolle spielen in diesem Zusammenhang Mutationen des Virus. Für eine erfolgreiche Eindämmung der Pandemie ist es daher entscheidend, einen detaillierten Überblick über die Ausbreitungsmuster spezifischer SARS-CoV-2-Mutationen zu erhalten und auch neue Mutation frühzeitig zu entdecken.

Hierfür stellt das Robert Koch-Institut die Systeme zur bundesweiten molekularen Surveillance bereit. Jedes Labor in Deutschland, das SARS-CoV-2 sequenziert, ist laut der Verordnung zur molekulargenetischen Surveillance des Coronavirus SARS-CoV-2 verpflichtet, dem Robert Koch-Institut die Sequenz- und zugehörige Metadaten zu übermitteln. Technisch erfolgt diese Übermittlung über den Deutschen Elektronischen Sequenzdaten-Hub (DESH).

Zu beachten ist, dass die Daten des Datensatzes keine weitere Qualitätskontrolle durch das RKI durchlaufen haben. Enthalten sind daher:

  • Sequenzdaten von niedriger Qualität
  • unverifizierte Frameshifts
  • Duplikate
  • Sequenzen die bereits vom sequenzierendem Labor veröffentlicht worden sind

Die hier veröffentlichten Daten können daher nicht ohne weiteres mit dem wöchentlichen Bericht zu Virusvarianten von SARS-CoV-2 in Deutschland des RKIs vergleichen werden.

Der Datensatz ist versioniert und wissenschaftlich zitierbar im europäischen Forschungsdatenrepositorium Zenodo.org und auf GitHub.com bereitgestellt:

Informationen zu den Datendateien:

Offenheit der Lizenz:
Freie Nutzung
Nutzungsbedingungen:
Creative Commons Namensnennung – 4.0 International (CC BY 4.0)
Letzte Änderung:
17.08.2021
Veröffentlichungsdatum:
20.07.2021
Datenbereitsteller:
Robert Koch-Institut
Veröffentlichende Stelle:
Robert Koch-Institut | MF 4 - Forschungsdatenmanagement
Kategorien:
Bevölkerung und Gesellschaft Bevölkerung und Gesellschaft
Gesundheit Gesundheit
Wissenschaft und Technologie Wissenschaft und Technologie
Zeitraum:
25.01.2021 -
Raumbezug:
-
Schlagwörter:
Basensequenz
COVID-19
Coronavirus
Deutschland
Genom
RKI
SARS-CoV-2
Virussequencen

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